Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNH2Q12809 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNH2Q12809 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNH2Q12809 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNH2Q12809 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNH2Q12809 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNH2Q12809 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNH2Q12809 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNH2Q12809 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNH2Q12809 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNH2Q12809 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNH2Q12809 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNH2Q12809 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNH2Q12809 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNH2Q12809 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNH2Q12809 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNH2Q12809 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNH2Q12809 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNH2Q12809 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNH2Q12809 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNH2Q12809 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNH2Q12809 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
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