Protein–RNA interactions for Protein: Q12420

SNU66, 66 kDa U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein component, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNU66Q12420 DSE1YER124C 1722 nt3.36□□□□□ -1.87
SNU66Q12420 MET5YJR137C 4329 nt3.35□□□□□ -1.87
SNU66Q12420 VPS64YDR200C 1815 nt3.35□□□□□ -1.87
SNU66Q12420 YCR100CYCR100C 951 nt3.35□□□□□ -1.87
SNU66Q12420 RPL13AYDL082W 600 nt3.35□□□□□ -1.87
SNU66Q12420 GEP7YGL057C 864 nt3.35□□□□□ -1.87
SNU66Q12420 HTD2YHR067W 843 nt3.35□□□□□ -1.87
SNU66Q12420 DLS1YJL065C 504 nt3.35□□□□□ -1.87
SNU66Q12420 YAL064WYAL064W 285 nt3.35□□□□□ -1.87
SNU66Q12420 REC102YLR329W 795 nt3.35□□□□□ -1.87
SNU66Q12420 YML037CYML037C 1023 nt3.35□□□□□ -1.87
SNU66Q12420 MCA1YOR197W 1299 nt3.35□□□□□ -1.87
SNU66Q12420 GCD6YDR211W 2139 nt3.35□□□□□ -1.87
SNU66Q12420 ARP9YMR033W 1404 nt3.35□□□□□ -1.87
SNU66Q12420 NDT80YHR124W 1884 nt3.35□□□□□ -1.87
SNU66Q12420 SLS1YLR139C 1932 nt3.34□□□□□ -1.87
SNU66Q12420 ART10YLR392C 1557 nt3.34□□□□□ -1.87
SNU66Q12420 NET1YJL076W 3570 nt3.34□□□□□ -1.87
SNU66Q12420 YER066C-AYER066C-A 501 nt3.34□□□□□ -1.87
SNU66Q12420 ERG25YGR060W 930 nt3.34□□□□□ -1.87
SNU66Q12420 TSR4YOL022C 1227 nt3.34□□□□□ -1.87
SNU66Q12420 BTS1YPL069C 1008 nt3.34□□□□□ -1.87
SNU66Q12420 snR44snR44 211 nt3.34□□□□□ -1.87
SNU66Q12420 YBR300CYBR300C 498 nt3.34□□□□□ -1.87
SNU66Q12420 PEX5YDR244W 1839 nt3.34□□□□□ -1.87
SNU66Q12420 YNL011CYNL011C 1335 nt3.34□□□□□ -1.87
SNU66Q12420 RPN1YHR027C 2982 nt3.34□□□□□ -1.87
SNU66Q12420 MSB2YGR014W 3921 nt3.34□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 YPL216WYPL216W 3309 nt3.34□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 COBQ0105 1158 nt3.33□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 YHR182C-AYHR182C-A 474 nt3.33□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 ATG27YJL178C 816 nt3.33□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 NNF1YJR112W 606 nt3.33□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 PEX15YOL044W 1152 nt3.33□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 MPD2YOL088C 834 nt3.33□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 MAK11YKL021C 1407 nt3.33□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 MSH4YFL003C 2637 nt3.33□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 BI3Q0115 1554 nt3.33□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 CCT7YJL111W 1653 nt3.33□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 SYO1YDL063C 1863 nt3.33□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 CSR2YPR030W 3366 nt3.32□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt3.32□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 YLR297WYLR297W 390 nt3.32□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 YLR339CYLR339C 552 nt3.32□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 UNG1YML021C 1080 nt3.32□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 SUB1YMR039C 879 nt3.32□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 YMR099CYMR099C 894 nt3.32□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 SRL1YOR247W 633 nt3.32□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 YPL276WYPL276W 438 nt3.32□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 snR70snR70 164 nt3.31□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 AI3Q0060 1248 nt3.31□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 PET100YDR079W 336 nt3.31□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 YGL159WYGL159W 1113 nt3.31□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 YGR160WYGR160W 612 nt3.31□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 INP1YMR204C 1263 nt3.31□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 YNL043CYNL043C 321 nt3.31□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 YNL226WYNL226W 411 nt3.31□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 RGR1YLR071C 3249 nt3.31□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 BPT1YLL015W 4680 nt3.31□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 BUB1YGR188C 3066 nt3.3□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 RRM3YHR031C 2172 nt3.3□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 YGL204CYGL204C 306 nt3.3□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 UPF3YGR072W 1164 nt3.3□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 YGR111WYGR111W 1203 nt3.3□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 VPS25YJR102C 609 nt3.3□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 MET14YKL001C 609 nt3.3□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 RPL20AYMR242C 519 nt3.3□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 CCL1YPR025C 1182 nt3.3□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 FAR1YJL157C 2493 nt3.3□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 RAX2YLR084C 3663 nt3.29□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 KRE2YDR483W 1329 nt3.29□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 UBC9YDL064W 474 nt3.29□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 YDR491CYDR491C 492 nt3.29□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt3.29□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt3.29□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt3.29□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt3.29□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt3.29□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 SEC28YIL076W 891 nt3.29□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt3.29□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt3.29□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 SUI2YJR007W 915 nt3.29□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 YAR069CYAR069C 294 nt3.29□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 HAT1YPL001W 1125 nt3.29□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 YPL107WYPL107W 747 nt3.29□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 DNA2YHR164C 4569 nt3.29□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 YHR078WYHR078W 1659 nt3.29□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 YDR061WYDR061W 1620 nt3.29□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 NAB6YML117W 3405 nt3.28□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 MIX14YDR031W 366 nt3.28□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 YGL082WYGL082W 1146 nt3.28□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 COX3Q0275 810 nt3.28□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 YJL169WYJL169W 369 nt3.28□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 YJR020WYJR020W 333 nt3.28□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 YKL091CYKL091C 933 nt3.28□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 TDA8YAL064C-A 381 nt3.28□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 YAL066WYAL066W 309 nt3.28□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 SPC2YML055W 537 nt3.28□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 THI80YOR143C 960 nt3.28□□□□□ -1.88
SNU66Q12420 RPL20BYOR312C 519 nt3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.8 ms