Protein–RNA interactions for Protein: Q12276

HER1, HMG2-induced ER-remodeling protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HER1Q12276 USA1YML029W 2517 nt3.49□□□□□ -1.85
HER1Q12276 SET1YHR119W 3243 nt3.49□□□□□ -1.85
HER1Q12276 SMC3YJL074C 3693 nt3.49□□□□□ -1.85
HER1Q12276 YKL075CYKL075C 1353 nt3.49□□□□□ -1.85
HER1Q12276 AI4Q0065 1671 nt3.49□□□□□ -1.85
HER1Q12276 ARO80YDR421W 2853 nt3.49□□□□□ -1.85
HER1Q12276 PDR12YPL058C 4536 nt3.49□□□□□ -1.85
HER1Q12276 PIG2YIL045W 1617 nt3.48□□□□□ -1.85
HER1Q12276 RUD3YOR216C 1455 nt3.48□□□□□ -1.85
HER1Q12276 RAD5YLR032W 3510 nt3.48□□□□□ -1.85
HER1Q12276 ASM4YDL088C 1587 nt3.48□□□□□ -1.85
HER1Q12276 RNT1YMR239C 1416 nt3.48□□□□□ -1.85
HER1Q12276 YDL163WYDL163W 303 nt3.48□□□□□ -1.85
HER1Q12276 QCR10YHR001W-A 234 nt3.48□□□□□ -1.85
HER1Q12276 YIL024CYIL024C 570 nt3.48□□□□□ -1.85
HER1Q12276 MRP8YKL142W 660 nt3.48□□□□□ -1.85
HER1Q12276 CDC123YLR215C 1083 nt3.48□□□□□ -1.85
HER1Q12276 IGO1YNL157W 507 nt3.48□□□□□ -1.85
HER1Q12276 CUR1YPR158W 759 nt3.48□□□□□ -1.85
HER1Q12276 PHO88YBR106W 567 nt3.48□□□□□ -1.85
HER1Q12276 NOG1YPL093W 1944 nt3.48□□□□□ -1.85
HER1Q12276 ARG2YJL071W 1725 nt3.47□□□□□ -1.85
HER1Q12276 BMS1YPL217C 3552 nt3.47□□□□□ -1.85
HER1Q12276 CLB3YDL155W 1284 nt3.47□□□□□ -1.85
HER1Q12276 YDR114CYDR114C 303 nt3.47□□□□□ -1.85
HER1Q12276 VPS74YDR372C 1038 nt3.47□□□□□ -1.85
HER1Q12276 MAK16YAL025C 921 nt3.47□□□□□ -1.85
HER1Q12276 YJR037WYJR037W 384 nt3.47□□□□□ -1.85
HER1Q12276 YLR290CYLR290C 834 nt3.47□□□□□ -1.85
HER1Q12276 FYV12YOR183W 390 nt3.47□□□□□ -1.85
HER1Q12276 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt3.47□□□□□ -1.85
HER1Q12276 RPB5YBR154C 648 nt3.47□□□□□ -1.85
HER1Q12276 KRE2YDR483W 1329 nt3.46□□□□□ -1.85
HER1Q12276 THR4YCR053W 1545 nt3.46□□□□□ -1.86
HER1Q12276 DUN1YDL101C 1542 nt3.46□□□□□ -1.86
HER1Q12276 YDR381C-AYDR381C-A 345 nt3.46□□□□□ -1.86
HER1Q12276 MIG3YER028C 1185 nt3.46□□□□□ -1.86
HER1Q12276 LIF1YGL090W 1266 nt3.46□□□□□ -1.86
HER1Q12276 BRR6YGL247W 594 nt3.46□□□□□ -1.86
HER1Q12276 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt3.46□□□□□ -1.86
HER1Q12276 YHR097CYHR097C 1101 nt3.46□□□□□ -1.86
HER1Q12276 IGO2YHR132W-A 396 nt3.46□□□□□ -1.86
HER1Q12276 YIL029CYIL029C 429 nt3.46□□□□□ -1.86
HER1Q12276 PEX11YOL147C 711 nt3.46□□□□□ -1.86
HER1Q12276 YRO2YBR054W 1035 nt3.46□□□□□ -1.86
HER1Q12276 YPR170CYPR170C 336 nt3.46□□□□□ -1.86
HER1Q12276 YCT1YLL055W 1596 nt3.46□□□□□ -1.86
HER1Q12276 RDS2YPL133C 1341 nt3.45□□□□□ -1.86
HER1Q12276 RPS0AYGR214W 759 nt3.45□□□□□ -1.86
HER1Q12276 SNX4YJL036W 1272 nt3.45□□□□□ -1.86
HER1Q12276 RPC37YKR025W 849 nt3.45□□□□□ -1.86
HER1Q12276 COQ5YML110C 924 nt3.45□□□□□ -1.86
HER1Q12276 RIM11YMR139W 1113 nt3.45□□□□□ -1.86
HER1Q12276 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt3.45□□□□□ -1.86
HER1Q12276 SLY41YOR307C 1362 nt3.45□□□□□ -1.86
HER1Q12276 FRE4YNR060W 2160 nt3.45□□□□□ -1.86
HER1Q12276 SEC27YGL137W 2670 nt3.45□□□□□ -1.86
HER1Q12276 ATG26YLR189C 3597 nt3.45□□□□□ -1.86
HER1Q12276 MIP6YHR015W 1980 nt3.44□□□□□ -1.86
HER1Q12276 STE24YJR117W 1362 nt3.44□□□□□ -1.86
HER1Q12276 PBP4YDL053C 558 nt3.44□□□□□ -1.86
HER1Q12276 OTU1YFL044C 906 nt3.44□□□□□ -1.86
HER1Q12276 AGA2YGL032C 264 nt3.44□□□□□ -1.86
HER1Q12276 TPK3YKL166C 1197 nt3.44□□□□□ -1.86
HER1Q12276 FLD1YLR404W 858 nt3.44□□□□□ -1.86
HER1Q12276 YNL235CYNL235C 432 nt3.44□□□□□ -1.86
HER1Q12276 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt3.44□□□□□ -1.86
HER1Q12276 MSN1YOL116W 1149 nt3.44□□□□□ -1.86
HER1Q12276 ROD1YOR018W 2514 nt3.44□□□□□ -1.86
HER1Q12276 ATP25YMR098C 1839 nt3.44□□□□□ -1.86
HER1Q12276 MSM1YGR171C 1728 nt3.44□□□□□ -1.86
HER1Q12276 KIN3YAR018C 1308 nt3.44□□□□□ -1.86
HER1Q12276 PHR1YOR386W 1698 nt3.43□□□□□ -1.86
HER1Q12276 PPQ1YPL179W 1650 nt3.43□□□□□ -1.86
HER1Q12276 EBS1YDR206W 2655 nt3.43□□□□□ -1.86
HER1Q12276 RPN2YIL075C 2838 nt3.43□□□□□ -1.86
HER1Q12276 YCR013CYCR013C 648 nt3.43□□□□□ -1.86
HER1Q12276 FAP7YDL166C 594 nt3.43□□□□□ -1.86
HER1Q12276 IES6YEL044W 501 nt3.43□□□□□ -1.86
HER1Q12276 GPP2YER062C 753 nt3.43□□□□□ -1.86
HER1Q12276 YGR161W-CYGR161W-C 279 nt3.43□□□□□ -1.86
HER1Q12276 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt3.43□□□□□ -1.86
HER1Q12276 DSE2YHR143W 978 nt3.43□□□□□ -1.86
HER1Q12276 YHR182C-AYHR182C-A 474 nt3.43□□□□□ -1.86
HER1Q12276 SGN1YIR001C 753 nt3.43□□□□□ -1.86
HER1Q12276 AIM26YKL037W 357 nt3.43□□□□□ -1.86
HER1Q12276 YKL063CYKL063C 504 nt3.43□□□□□ -1.86
HER1Q12276 YKT6YKL196C 603 nt3.43□□□□□ -1.86
HER1Q12276 YLR400WYLR400W 474 nt3.43□□□□□ -1.86
HER1Q12276 VAM10YOR068C 345 nt3.43□□□□□ -1.86
HER1Q12276 RPA43YOR340C 981 nt3.43□□□□□ -1.86
HER1Q12276 ALG14YBR070C 714 nt3.43□□□□□ -1.86
HER1Q12276 AVT2YEL064C 1443 nt3.43□□□□□ -1.86
HER1Q12276 PRP22YER013W 3438 nt3.42□□□□□ -1.86
HER1Q12276 YJL049WYJL049W 1353 nt3.42□□□□□ -1.86
HER1Q12276 RPS14AYCR031C 414 nt3.42□□□□□ -1.86
HER1Q12276 YDL187CYDL187C 330 nt3.42□□□□□ -1.86
HER1Q12276 YPD1YDL235C 504 nt3.42□□□□□ -1.86
HER1Q12276 YDR431WYDR431W 312 nt3.42□□□□□ -1.86
HER1Q12276 RPS8BYER102W 603 nt3.42□□□□□ -1.86
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