Protein–RNA interactions for Protein: Q08923

CTI6, Histone deacetylase complex subunit CTI6, yeastyeast

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTI6Q08923 YBP2YGL060W 1926 nt3.44□□□□□ -1.86
CTI6Q08923 CIN1YOR349W 3045 nt3.44□□□□□ -1.86
CTI6Q08923 RPN3YER021W 1572 nt3.44□□□□□ -1.86
CTI6Q08923 LIF1YGL090W 1266 nt3.44□□□□□ -1.86
CTI6Q08923 GTR2YGR163W 1026 nt3.44□□□□□ -1.86
CTI6Q08923 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt3.44□□□□□ -1.86
CTI6Q08923 LCL2YLR104W 396 nt3.44□□□□□ -1.86
CTI6Q08923 YLR257WYLR257W 966 nt3.44□□□□□ -1.86
CTI6Q08923 RPL6AYML073C 531 nt3.44□□□□□ -1.86
CTI6Q08923 YNL184CYNL184C 327 nt3.44□□□□□ -1.86
CTI6Q08923 YBR090CYBR090C 369 nt3.44□□□□□ -1.86
CTI6Q08923 NGG1YDR176W 2109 nt3.44□□□□□ -1.86
CTI6Q08923 ERG9YHR190W 1335 nt3.44□□□□□ -1.86
CTI6Q08923 PHO81YGR233C 3537 nt3.43□□□□□ -1.86
CTI6Q08923 POL2YNL262W 6669 nt3.43□□□□□ -1.86
CTI6Q08923 YCR099CYCR099C 468 nt3.43□□□□□ -1.86
CTI6Q08923 YFH7YFR007W 1062 nt3.43□□□□□ -1.86
CTI6Q08923 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt3.43□□□□□ -1.86
CTI6Q08923 YPT6YLR262C 648 nt3.43□□□□□ -1.86
CTI6Q08923 URA5YML106W 681 nt3.43□□□□□ -1.86
CTI6Q08923 SPR2YOR214C 711 nt3.43□□□□□ -1.86
CTI6Q08923 MGE1YOR232W 687 nt3.43□□□□□ -1.86
CTI6Q08923 RPL20BYOR312C 519 nt3.43□□□□□ -1.86
CTI6Q08923 TRM82YDR165W 1335 nt3.43□□□□□ -1.86
CTI6Q08923 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt3.43□□□□□ -1.86
CTI6Q08923 RAD5YLR032W 3510 nt3.43□□□□□ -1.86
CTI6Q08923 AIM11YER093C-A 414 nt3.42□□□□□ -1.86
CTI6Q08923 SMX2YFL017W-A 234 nt3.42□□□□□ -1.86
CTI6Q08923 YHL005CYHL005C 393 nt3.42□□□□□ -1.86
CTI6Q08923 YJL114WYJL114W 681 nt3.42□□□□□ -1.86
CTI6Q08923 VMA5YKL080W 1179 nt3.42□□□□□ -1.86
CTI6Q08923 NDL1YLR254C 570 nt3.42□□□□□ -1.86
CTI6Q08923 FAR3YMR052W 615 nt3.42□□□□□ -1.86
CTI6Q08923 VAM10YOR068C 345 nt3.42□□□□□ -1.86
CTI6Q08923 SCD6YPR129W 1050 nt3.42□□□□□ -1.86
CTI6Q08923 CST9YLR394W 1449 nt3.42□□□□□ -1.86
CTI6Q08923 PEX6YNL329C 3093 nt3.42□□□□□ -1.86
CTI6Q08923 VBA4YDR119W 2307 nt3.41□□□□□ -1.86
CTI6Q08923 RED1YLR263W 2484 nt3.41□□□□□ -1.86
CTI6Q08923 YDL158CYDL158C 309 nt3.41□□□□□ -1.86
CTI6Q08923 snR83snR83 306 nt3.41□□□□□ -1.86
CTI6Q08923 NRG1YDR043C 696 nt3.41□□□□□ -1.86
CTI6Q08923 THO1YER063W 657 nt3.41□□□□□ -1.86
CTI6Q08923 YGR073CYGR073C 372 nt3.41□□□□□ -1.86
CTI6Q08923 RPN13YLR421C 471 nt3.41□□□□□ -1.86
CTI6Q08923 RPL6BYLR448W 531 nt3.41□□□□□ -1.86
CTI6Q08923 YOL114CYOL114C 609 nt3.41□□□□□ -1.86
CTI6Q08923 ARL1YBR164C 552 nt3.41□□□□□ -1.86
CTI6Q08923 SRP1YNL189W 1629 nt3.41□□□□□ -1.86
CTI6Q08923 SET1YHR119W 3243 nt3.4□□□□□ -1.86
CTI6Q08923 SRP68YPL243W 1800 nt3.4□□□□□ -1.86
CTI6Q08923 MGT1YDL200C 567 nt3.4□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 XRN1YGL173C 4587 nt3.4□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 VEL1YGL258W 621 nt3.4□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 MRPL9YGR220C 810 nt3.4□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt3.4□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 YAP5YIR018W 738 nt3.4□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 DAL2YIR029W 1032 nt3.4□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 YLR050CYLR050C 486 nt3.4□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 AEP1YMR064W 1557 nt3.4□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 TPT1YOL102C 693 nt3.4□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 ATP20YPR020W 348 nt3.4□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 LTP1YPR073C 486 nt3.4□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 MED8YBR193C 672 nt3.4□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 YBR287WYBR287W 1284 nt3.4□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 YDR186CYDR186C 2634 nt3.4□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 GUP1YGL084C 1683 nt3.39□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 DNA2YHR164C 4569 nt3.39□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 SYO1YDL063C 1863 nt3.39□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 MDM36YPR083W 1740 nt3.39□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 PEX1YKL197C 3132 nt3.39□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 DIG2YDR480W 972 nt3.39□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 YFL012WYFL012W 447 nt3.39□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 RPS23AYGR118W 438 nt3.39□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 DLS1YJL065C 504 nt3.39□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 RPS23BYPR132W 438 nt3.39□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 UBP14YBR058C 2346 nt3.39□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt3.39□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 YBL005W-AYBL005W-A 1323 nt3.39□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 YMR046CYMR046C 1323 nt3.39□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt3.39□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 HEF3YNL014W 3135 nt3.39□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 NDC80YIL144W 2076 nt3.39□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 MPS1YDL028C 2295 nt3.39□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 FLO9YAL063C 3969 nt3.38□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 YDL050CYDL050C 372 nt3.38□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 STE2YFL026W 1296 nt3.38□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 PEF1YGR058W 1008 nt3.38□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 HHF2YNL030W 312 nt3.38□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 INO4YOL108C 456 nt3.38□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 SME1YOR159C 285 nt3.38□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 SAS5YOR213C 747 nt3.38□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 VPS38YLR360W 1320 nt3.38□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 FLO1YAR050W 4614 nt3.38□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 TPO5YKL174C 1857 nt3.37□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 POL4YCR014C 1749 nt3.37□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 FMN1YDR236C 657 nt3.37□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 GOS1YHL031C 672 nt3.37□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 YJL032WYJL032W 315 nt3.37□□□□□ -1.87
CTI6Q08923 YKL115CYKL115C 393 nt3.37□□□□□ -1.87
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