Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CYP4F3Q08477 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CYP4F3Q08477 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms