Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK18Q07002 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK18Q07002 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK18Q07002 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK18Q07002 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK18Q07002 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK18Q07002 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK18Q07002 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK18Q07002 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK18Q07002 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK18Q07002 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK18Q07002 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK18Q07002 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK18Q07002 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK18Q07002 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK18Q07002 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK18Q07002 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK18Q07002 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK18Q07002 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK18Q07002 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK18Q07002 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK18Q07002 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK18Q07002 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK18Q07002 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK18Q07002 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK18Q07002 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK18Q07002 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK18Q07002 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK18Q07002 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK18Q07002 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK18Q07002 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK18Q07002 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK18Q07002 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK18Q07002 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK18Q07002 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK18Q07002 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK18Q07002 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK18Q07002 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK18Q07002 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK18Q07002 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK18Q07002 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK18Q07002 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDK18Q07002 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK18Q07002 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDK18Q07002 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK18Q07002 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK18Q07002 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK18Q07002 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK18Q07002 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK18Q07002 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK18Q07002 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK18Q07002 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK18Q07002 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK18Q07002 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDK18Q07002 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK18Q07002 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDK18Q07002 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK18Q07002 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK18Q07002 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDK18Q07002 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDK18Q07002 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDK18Q07002 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDK18Q07002 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDK18Q07002 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDK18Q07002 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK18Q07002 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK18Q07002 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK18Q07002 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CDK18Q07002 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK18Q07002 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK18Q07002 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK18Q07002 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK18Q07002 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK18Q07002 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK18Q07002 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CDK18Q07002 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CDK18Q07002 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK18Q07002 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK18Q07002 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK18Q07002 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK18Q07002 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK18Q07002 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK18Q07002 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK18Q07002 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK18Q07002 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK18Q07002 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK18Q07002 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK18Q07002 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK18Q07002 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK18Q07002 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK18Q07002 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK18Q07002 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK18Q07002 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK18Q07002 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK18Q07002 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK18Q07002 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK18Q07002 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK18Q07002 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CDK18Q07002 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK18Q07002 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms