Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SOX4Q06945 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SOX4Q06945 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms