Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GABPAQ06546 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GABPAQ06546 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms