Protein–RNA interactions for Protein: Q06148

NEJ1, Non-homologous end-joining protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NEJ1Q06148 YDL050CYDL050C 372 nt2.24□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 ARI1YGL157W 1044 nt2.24□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 PRP18YGR006W 756 nt2.24□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 YIL161WYIL161W 708 nt2.24□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 HOT13YKL084W 351 nt2.24□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 YLL037WYLL037W 381 nt2.24□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 YMR187CYMR187C 1296 nt2.24□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 YNL184CYNL184C 327 nt2.24□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt2.24□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 YOR062CYOR062C 807 nt2.24□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 PRM4YPL156C 855 nt2.24□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 MNT3YIL014W 1893 nt2.24□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 FAR11YNL127W 2862 nt2.24□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 SUL1YBR294W 2580 nt2.23□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 YCR064CYCR064C 411 nt2.23□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 YEL075CYEL075C 369 nt2.23□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt2.23□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 YGL138CYGL138C 1038 nt2.23□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 MPC3YGR243W 441 nt2.23□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 TCD1YHR003C 1290 nt2.23□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 YHR213WYHR213W 597 nt2.23□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 YJR071WYJR071W 369 nt2.23□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 DAD2YKR083C 402 nt2.23□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 COA4YLR218C 453 nt2.23□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 YAR062WYAR062W 597 nt2.23□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 RPS29AYLR388W 171 nt2.23□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 SSP2YOR242C 1116 nt2.23□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 FIG1YBR040W 897 nt2.23□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 SUT2YPR009W 807 nt2.23□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 SCD5YOR329C 2619 nt2.23□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 NEW1YPL226W 3591 nt2.23□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 YCG1YDR325W 3108 nt2.23□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 YKL100CYKL100C 1764 nt2.23□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 VHR1YIL056W 1923 nt2.23□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 ARF1YDL192W 546 nt2.22□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 RRG1YDR065W 1098 nt2.22□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 PET100YDR079W 336 nt2.22□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 YIL054WYIL054W 318 nt2.22□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 ARC19YKL013C 516 nt2.22□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 RIF2YLR453C 1188 nt2.22□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 YNL171CYNL171C 369 nt2.22□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 IZH4YOL101C 939 nt2.22□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 RPB8YOR224C 441 nt2.22□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 VMA9YCL005W-A 222 nt2.22□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 TOR1YJR066W 7413 nt2.22□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 PDR11YIL013C 4236 nt2.22□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 WHI3YNL197C 1986 nt2.21□□□□□ -2.05
NEJ1Q06148 FKS3YMR306W 5358 nt2.21□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 YDR336WYDR336W 945 nt2.21□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 SMX2YFL017W-A 234 nt2.21□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 BRR6YGL247W 594 nt2.21□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 YGR073CYGR073C 372 nt2.21□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 MBB1YJL199C 327 nt2.21□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 AIM32YML050W 936 nt2.21□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 SST2YLR452C 2097 nt2.21□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 SSD1YDR293C 3753 nt2.21□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 KHA1YJL094C 2622 nt2.21□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 YPK1YKL126W 2043 nt2.2□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 HFM1YGL251C 3564 nt2.2□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.2□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.2□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.2□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.2□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 RGI2YIL057C 495 nt2.2□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.2□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 GAB1YLR459W 1185 nt2.2□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 YNL203CYNL203C 612 nt2.2□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 BTS1YPL069C 1008 nt2.2□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 APD1YBR151W 951 nt2.2□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 PHO91YNR013C 2685 nt2.2□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 TPO5YKL174C 1857 nt2.2□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 UTP6YDR449C 1323 nt2.19□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 FRE8YLR047C 2061 nt2.19□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 MRP10YDL045W-A 288 nt2.19□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 NSA2YER126C 786 nt2.19□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 YFR010W-AYFR010W-A 189 nt2.19□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 OTU2YHL013C 924 nt2.19□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 PEX18YHR160C 852 nt2.19□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 YIL102C-AYIL102C-A 228 nt2.19□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 YLR076CYLR076C 423 nt2.19□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 YLR400WYLR400W 474 nt2.19□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 RPS1AYLR441C 768 nt2.19□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 ATG16YMR159C 453 nt2.19□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 PEX17YNL214W 600 nt2.19□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 YOR203WYOR203W 354 nt2.19□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 POL30YBR088C 777 nt2.19□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 CTP1YBR291C 900 nt2.19□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 IRC8YJL051W 2469 nt2.19□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 UBP15YMR304W 3693 nt2.19□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 SGS1YMR190C 4344 nt2.19□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 DNF1YER166W 4716 nt2.19□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 CSF1YLR087C 8877 nt2.19□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 RED1YLR263W 2484 nt2.18□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 TOF1YNL273W 3717 nt2.18□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 PSP1YDR505C 2526 nt2.18□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 DUG2YBR281C 2637 nt2.18□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 GYL1YMR192W 2163 nt2.18□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 ECM11YDR446W 909 nt2.18□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.18□□□□□ -2.06
NEJ1Q06148 GPI14YJR013W 1212 nt2.18□□□□□ -2.06
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