Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHRNB3Q05901 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHRNB3Q05901 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms