Protein–RNA interactions for Protein: Q05900

YHC1, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHC1Q05900 SAS5YOR213C 747 nt2.72□□□□□ -1.97
YHC1Q05900 RPL33AYPL143W 324 nt2.72□□□□□ -1.97
YHC1Q05900 RPL1AYPL220W 654 nt2.72□□□□□ -1.97
YHC1Q05900 MED8YBR193C 672 nt2.72□□□□□ -1.97
YHC1Q05900 ECM29YHL030W 5607 nt2.72□□□□□ -1.97
YHC1Q05900 BCH1YMR237W 2175 nt2.71□□□□□ -1.97
YHC1Q05900 YDL050CYDL050C 372 nt2.71□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 FMN1YDR236C 657 nt2.71□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 HMF1YER057C 390 nt2.71□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 SMX2YFL017W-A 234 nt2.71□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 YJL032WYJL032W 315 nt2.71□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 YJL114WYJL114W 681 nt2.71□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt2.71□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 ATG10YLL042C 504 nt2.71□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 FAR3YMR052W 615 nt2.71□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 YSF3YNL138W-A 258 nt2.71□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 TPT1YOL102C 693 nt2.71□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 TPO5YKL174C 1857 nt2.71□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 DBP7YKR024C 2229 nt2.7□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt2.7□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 RAX2YLR084C 3663 nt2.7□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 NKP1YDR383C 717 nt2.7□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 YFL012WYFL012W 447 nt2.7□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 YKL115CYKL115C 393 nt2.7□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 SRL1YOR247W 633 nt2.7□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 PAM1YDR251W 2493 nt2.7□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 GYP7YDL234C 2241 nt2.7□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 MDM36YPR083W 1740 nt2.7□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 CIN1YOR349W 3045 nt2.7□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 YBR259WYBR259W 2067 nt2.7□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 CDC20YGL116W 1833 nt2.7□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 AEP1YMR064W 1557 nt2.7□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 YOR296WYOR296W 3870 nt2.69□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 TRM82YDR165W 1335 nt2.69□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt2.69□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 YBL005W-AYBL005W-A 1323 nt2.69□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 YMR046CYMR046C 1323 nt2.69□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt2.69□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 CBP2YHL038C 1893 nt2.69□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 SET1YHR119W 3243 nt2.69□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 URK1YNR012W 1506 nt2.69□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 YER165C-AYER165C-A 357 nt2.69□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 RPS22AYJL190C 393 nt2.69□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 TDA8YAL064C-A 381 nt2.69□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 YLR217WYLR217W 324 nt2.69□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 LIP2YLR239C 987 nt2.69□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 INO4YOL108C 456 nt2.69□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 YOL114CYOL114C 609 nt2.69□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 ATP20YPR020W 348 nt2.69□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 APD1YBR151W 951 nt2.69□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 POL3YDL102W 3294 nt2.69□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 NDC80YIL144W 2076 nt2.69□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 VPS38YLR360W 1320 nt2.68□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 HBT1YDL223C 3141 nt2.68□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 MRS2YOR334W 1413 nt2.68□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 MSB2YGR014W 3921 nt2.68□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 ENA5YDR038C 3276 nt2.68□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 VBA4YDR119W 2307 nt2.68□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 MAK5YBR142W 2322 nt2.68□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 NRG1YDR043C 696 nt2.68□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 YDR193WYDR193W 399 nt2.68□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 DIG2YDR480W 972 nt2.68□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 YGR115CYGR115C 780 nt2.68□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 MRPL9YGR220C 810 nt2.68□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt2.68□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 ILV5YLR355C 1188 nt2.68□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 RPL6BYLR448W 531 nt2.68□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 SRP68YPL243W 1800 nt2.68□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 BNA4YBL098W 1383 nt2.67□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 RMD6YEL072W 696 nt2.67□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 STE2YFL026W 1296 nt2.67□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 YGR073CYGR073C 372 nt2.67□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 VMA5YKL080W 1179 nt2.67□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 YKR033CYKR033C 426 nt2.67□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 YLR012CYLR012C 300 nt2.67□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 YLR050CYLR050C 486 nt2.67□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 APC9YLR102C 798 nt2.67□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 SME1YOR159C 285 nt2.67□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 MSH2YOL090W 2895 nt2.67□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 STP2YHR006W 1626 nt2.67□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 ECM21YBL101C 3354 nt2.67□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 CDC37YDR168W 1521 nt2.67□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 INP52YNL106C 3552 nt2.66□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt2.66□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 THO1YER063W 657 nt2.66□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 YGL214WYGL214W 486 nt2.66□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 GOS1YHL031C 672 nt2.66□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 VMA10YHR039C-A 345 nt2.66□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 RPL15AYLR029C 615 nt2.66□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 JIP3YLR331C 378 nt2.66□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 SUB1YMR039C 879 nt2.66□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 RPL13BYMR142C 600 nt2.66□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 RUF5-1RUF5-1 710 nt2.66□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 RUF5-2RUF5-2 710 nt2.66□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 PEX27YOR193W 1131 nt2.66□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 LTP1YPR073C 486 nt2.66□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 snR35snR35 204 nt2.66□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 REG1YDR028C 3045 nt2.66□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 TOM1YDR457W 9807 nt2.66□□□□□ -1.98
YHC1Q05900 IOC3YFR013W 2364 nt2.66□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24.5 ms