Protein–RNA interactions for Protein: Q05549

HRQ1, ATP-dependent helicase HRQ1, yeastyeast

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Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRQ1Q05549 TPM2YIL138C 486 nt4.3□□□□□ -1.72
HRQ1Q05549 YPR022CYPR022C 3402 nt4.3□□□□□ -1.72
HRQ1Q05549 YDL199CYDL199C 2064 nt4.3□□□□□ -1.72
HRQ1Q05549 ROK1YGL171W 1695 nt4.29□□□□□ -1.72
HRQ1Q05549 MNN1YER001W 2289 nt4.29□□□□□ -1.72
HRQ1Q05549 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt4.29□□□□□ -1.72
HRQ1Q05549 IZH3YLR023C 1632 nt4.29□□□□□ -1.72
HRQ1Q05549 YDR115WYDR115W 318 nt4.29□□□□□ -1.72
HRQ1Q05549 RSM24YDR175C 960 nt4.29□□□□□ -1.72
HRQ1Q05549 YHI9YHR029C 885 nt4.29□□□□□ -1.72
HRQ1Q05549 IRC18YJL037W 675 nt4.29□□□□□ -1.72
HRQ1Q05549 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt4.29□□□□□ -1.72
HRQ1Q05549 AFB1YLR040C 675 nt4.29□□□□□ -1.72
HRQ1Q05549 YNL181WYNL181W 1224 nt4.29□□□□□ -1.72
HRQ1Q05549 YOL159CYOL159C 516 nt4.29□□□□□ -1.72
HRQ1Q05549 YPR050CYPR050C 414 nt4.29□□□□□ -1.72
HRQ1Q05549 YSY6YBR162W-A 198 nt4.29□□□□□ -1.72
HRQ1Q05549 MDM30YLR368W 1797 nt4.29□□□□□ -1.72
HRQ1Q05549 RNT1YMR239C 1416 nt4.29□□□□□ -1.72
HRQ1Q05549 PPN1YDR452W 2025 nt4.28□□□□□ -1.72
HRQ1Q05549 RNA14YMR061W 2034 nt4.28□□□□□ -1.72
HRQ1Q05549 YDR340WYDR340W 303 nt4.28□□□□□ -1.72
HRQ1Q05549 YER079WYER079W 633 nt4.28□□□□□ -1.72
HRQ1Q05549 YER087C-AYER087C-A 552 nt4.28□□□□□ -1.72
HRQ1Q05549 YGL039WYGL039W 1047 nt4.28□□□□□ -1.72
HRQ1Q05549 YAP3YHL009C 993 nt4.28□□□□□ -1.72
HRQ1Q05549 YIL175WYIL175W 318 nt4.28□□□□□ -1.72
HRQ1Q05549 YOR082CYOR082C 342 nt4.28□□□□□ -1.72
HRQ1Q05549 YPL107WYPL107W 747 nt4.28□□□□□ -1.72
HRQ1Q05549 TPK2YPL203W 1143 nt4.28□□□□□ -1.72
HRQ1Q05549 SYO1YDL063C 1863 nt4.28□□□□□ -1.72
HRQ1Q05549 OSH3YHR073W 2991 nt4.28□□□□□ -1.72
HRQ1Q05549 EPO1YMR124W 2832 nt4.27□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 DAS1YJL149W 1992 nt4.27□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 MNR2YKL064W 2910 nt4.27□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 NDC80YIL144W 2076 nt4.27□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 ULP1YPL020C 1866 nt4.27□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 NOP6YDL213C 678 nt4.27□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 YGL074CYGL074C 327 nt4.27□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 VMA10YHR039C-A 345 nt4.27□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt4.27□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 ACF4YJR083C 930 nt4.27□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 IDP2YLR174W 1239 nt4.27□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 CTK3YML112W 891 nt4.27□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 VAM10YOR068C 345 nt4.27□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 YOR105WYOR105W 327 nt4.27□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 YOR199WYOR199W 330 nt4.27□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 PHO88YBR106W 567 nt4.27□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 MBA1YBR185C 837 nt4.27□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 GPX2YBR244W 489 nt4.27□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 SPT6YGR116W 4356 nt4.27□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 TRX3YCR083W 384 nt4.26□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 ECM34YHL043W 513 nt4.26□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 YHR138CYHR138C 345 nt4.26□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 YIR020CYIR020C 303 nt4.26□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt4.26□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 YKL162C-AYKL162C-A 153 nt4.26□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 RAD33YML011C 534 nt4.26□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 GRE2YOL151W 1029 nt4.26□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt4.26□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 DER1YBR201W 636 nt4.26□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 snR54snR54 86 nt4.26□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 YKR078WYKR078W 1758 nt4.26□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 FMP25YLR077W 1752 nt4.26□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 ISW2YOR304W 3363 nt4.25□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 EXO5YBR163W 1758 nt4.25□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 RRP42YDL111C 798 nt4.25□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 NUG1YER006W 1563 nt4.25□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 YFL015CYFL015C 495 nt4.25□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 tL(UAG)JtL(UAG)J 82 nt4.25□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt4.25□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt4.25□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 RTS3YGR161C 792 nt4.25□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt4.25□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 SEC22YLR268W 645 nt4.25□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 YLR287CYLR287C 1068 nt4.25□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 DDR48YMR173W 1293 nt4.25□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 AFT2YPL202C 1251 nt4.25□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 AIM4YBR194W 372 nt4.25□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 STE24YJR117W 1362 nt4.25□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 PUB1YNL016W 1362 nt4.25□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 HDA2YDR295C 2025 nt4.24□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 MUD2YKL074C 1584 nt4.24□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt4.24□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 ATG31YDR022C 591 nt4.24□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 YDR133CYDR133C 336 nt4.24□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 YER046W-AYER046W-A 330 nt4.24□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 YGL140CYGL140C 3660 nt4.24□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 TEL1YBL088C 8364 nt4.24□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 EXO70YJL085W 1872 nt4.24□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 GWT1YJL091C 1473 nt4.24□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 CDC45YLR103C 1953 nt4.23□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt4.23□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 SWC4YGR002C 1431 nt4.23□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 UBP12YJL197W 3765 nt4.23□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 YPR003CYPR003C 2265 nt4.23□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 SLA1YBL007C 3735 nt4.23□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 RPP1AYDL081C 321 nt4.23□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 YER006C-AYER006C-A 318 nt4.23□□□□□ -1.73
HRQ1Q05549 YKL044WYKL044W 321 nt4.23□□□□□ -1.73
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