Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SSBP1Q04837 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SSBP1Q04837 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms