Protein–RNA interactions for Protein: Q04695

KRT17, Keratin, type I cytoskeletal 17, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT17Q04695 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT17Q04695 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KRT17Q04695 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms