Protein–RNA interactions for Protein: Q03167

TGFBR3, Transforming growth factor beta receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR3Q03167 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGFBR3Q03167 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms