Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GCNT1Q02742 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNT1Q02742 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms