Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EXOSC10Q01780 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EXOSC10Q01780 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms