Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SKOR1P84550 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SKOR1P84550 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms