Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRX3P78415 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRX3P78415 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRX3P78415 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IRX3P78415 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IRX3P78415 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IRX3P78415 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IRX3P78415 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
IRX3P78415 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IRX3P78415 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IRX3P78415 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IRX3P78415 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IRX3P78415 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IRX3P78415 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IRX3P78415 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IRX3P78415 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRX3P78415 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRX3P78415 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRX3P78415 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRX3P78415 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRX3P78415 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRX3P78415 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRX3P78415 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRX3P78415 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRX3P78415 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRX3P78415 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
IRX3P78415 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRX3P78415 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRX3P78415 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
IRX3P78415 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRX3P78415 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IRX3P78415 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IRX3P78415 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IRX3P78415 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IRX3P78415 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IRX3P78415 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IRX3P78415 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IRX3P78415 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IRX3P78415 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IRX3P78415 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IRX3P78415 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IRX3P78415 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IRX3P78415 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRX3P78415 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRX3P78415 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRX3P78415 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRX3P78415 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRX3P78415 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRX3P78415 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRX3P78415 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
IRX3P78415 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRX3P78415 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRX3P78415 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
IRX3P78415 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRX3P78415 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRX3P78415 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRX3P78415 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRX3P78415 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRX3P78415 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRX3P78415 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRX3P78415 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRX3P78415 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRX3P78415 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRX3P78415 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRX3P78415 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRX3P78415 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRX3P78415 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRX3P78415 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRX3P78415 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRX3P78415 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
IRX3P78415 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRX3P78415 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRX3P78415 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRX3P78415 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
IRX3P78415 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRX3P78415 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRX3P78415 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRX3P78415 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRX3P78415 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRX3P78415 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRX3P78415 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRX3P78415 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
IRX3P78415 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRX3P78415 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRX3P78415 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRX3P78415 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRX3P78415 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRX3P78415 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRX3P78415 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRX3P78415 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRX3P78415 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IRX3P78415 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IRX3P78415 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
IRX3P78415 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IRX3P78415 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IRX3P78415 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IRX3P78415 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRX3P78415 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
IRX3P78415 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRX3P78415 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms