Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTBP60709 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTBP60709 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTBP60709 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTBP60709 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTBP60709 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTBP60709 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTBP60709 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTBP60709 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTBP60709 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTBP60709 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTBP60709 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTBP60709 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTBP60709 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTBP60709 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTBP60709 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTBP60709 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTBP60709 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTBP60709 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTBP60709 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTBP60709 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTBP60709 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTBP60709 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTBP60709 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTBP60709 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACTBP60709 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTBP60709 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTBP60709 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTBP60709 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTBP60709 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTBP60709 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTBP60709 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTBP60709 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTBP60709 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTBP60709 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTBP60709 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTBP60709 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTBP60709 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTBP60709 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTBP60709 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTBP60709 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTBP60709 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTBP60709 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTBP60709 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTBP60709 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTBP60709 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTBP60709 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTBP60709 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTBP60709 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTBP60709 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTBP60709 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTBP60709 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTBP60709 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTBP60709 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTBP60709 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTBP60709 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTBP60709 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTBP60709 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTBP60709 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTBP60709 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTBP60709 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTBP60709 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTBP60709 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTBP60709 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTBP60709 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTBP60709 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTBP60709 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTBP60709 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTBP60709 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTBP60709 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTBP60709 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTBP60709 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTBP60709 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTBP60709 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTBP60709 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTBP60709 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTBP60709 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTBP60709 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTBP60709 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTBP60709 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTBP60709 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTBP60709 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTBP60709 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTBP60709 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTBP60709 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTBP60709 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTBP60709 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTBP60709 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTBP60709 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTBP60709 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTBP60709 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTBP60709 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTBP60709 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTBP60709 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTBP60709 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTBP60709 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTBP60709 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTBP60709 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTBP60709 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTBP60709 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms