Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ERVPABLB-1P60509 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
ERVPABLB-1P60509 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ERVPABLB-1P60509 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms