Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ERVFC1P60507 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVFC1P60507 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms