Protein–RNA interactions for Protein: P60174

TPI1, Triosephosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPI1P60174 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPI1P60174 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPI1P60174 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TPI1P60174 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TPI1P60174 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPI1P60174 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPI1P60174 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPI1P60174 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPI1P60174 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TPI1P60174 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPI1P60174 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPI1P60174 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TPI1P60174 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TPI1P60174 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPI1P60174 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPI1P60174 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TPI1P60174 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPI1P60174 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TPI1P60174 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPI1P60174 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPI1P60174 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPI1P60174 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TPI1P60174 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPI1P60174 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPI1P60174 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPI1P60174 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPI1P60174 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPI1P60174 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TPI1P60174 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TPI1P60174 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPI1P60174 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TPI1P60174 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPI1P60174 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPI1P60174 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TPI1P60174 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPI1P60174 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TPI1P60174 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPI1P60174 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPI1P60174 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPI1P60174 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPI1P60174 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPI1P60174 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPI1P60174 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPI1P60174 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPI1P60174 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPI1P60174 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPI1P60174 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPI1P60174 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPI1P60174 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPI1P60174 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPI1P60174 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TPI1P60174 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPI1P60174 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPI1P60174 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPI1P60174 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPI1P60174 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPI1P60174 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPI1P60174 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPI1P60174 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPI1P60174 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPI1P60174 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPI1P60174 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TPI1P60174 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPI1P60174 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPI1P60174 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPI1P60174 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TPI1P60174 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPI1P60174 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TPI1P60174 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TPI1P60174 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TPI1P60174 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TPI1P60174 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TPI1P60174 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TPI1P60174 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TPI1P60174 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TPI1P60174 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TPI1P60174 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPI1P60174 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPI1P60174 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPI1P60174 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TPI1P60174 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPI1P60174 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPI1P60174 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TPI1P60174 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPI1P60174 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPI1P60174 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPI1P60174 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPI1P60174 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TPI1P60174 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPI1P60174 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPI1P60174 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPI1P60174 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPI1P60174 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPI1P60174 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPI1P60174 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPI1P60174 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TPI1P60174 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPI1P60174 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPI1P60174 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TPI1P60174 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms