Protein–RNA interactions for Protein: P56559

ARL4C, ADP-ribosylation factor-like protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4CP56559 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARL4CP56559 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ARL4CP56559 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ARL4CP56559 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ARL4CP56559 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ARL4CP56559 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ARL4CP56559 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ARL4CP56559 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ARL4CP56559 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ARL4CP56559 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ARL4CP56559 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARL4CP56559 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARL4CP56559 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARL4CP56559 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARL4CP56559 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARL4CP56559 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ARL4CP56559 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARL4CP56559 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARL4CP56559 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARL4CP56559 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARL4CP56559 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARL4CP56559 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARL4CP56559 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARL4CP56559 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ARL4CP56559 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARL4CP56559 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARL4CP56559 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARL4CP56559 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARL4CP56559 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ARL4CP56559 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARL4CP56559 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARL4CP56559 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARL4CP56559 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ARL4CP56559 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ARL4CP56559 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARL4CP56559 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARL4CP56559 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARL4CP56559 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARL4CP56559 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARL4CP56559 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms