Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCL23P55773 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCL23P55773 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCL23P55773 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCL23P55773 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCL23P55773 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCL23P55773 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCL23P55773 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCL23P55773 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCL23P55773 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCL23P55773 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCL23P55773 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCL23P55773 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCL23P55773 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL23P55773 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL23P55773 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL23P55773 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL23P55773 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL23P55773 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL23P55773 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL23P55773 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL23P55773 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL23P55773 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL23P55773 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL23P55773 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL23P55773 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL23P55773 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL23P55773 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL23P55773 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL23P55773 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL23P55773 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL23P55773 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL23P55773 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL23P55773 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL23P55773 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCL23P55773 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL23P55773 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL23P55773 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL23P55773 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL23P55773 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL23P55773 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL23P55773 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL23P55773 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL23P55773 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL23P55773 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL23P55773 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL23P55773 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL23P55773 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL23P55773 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL23P55773 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL23P55773 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL23P55773 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL23P55773 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL23P55773 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCL23P55773 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCL23P55773 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCL23P55773 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCL23P55773 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCL23P55773 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCL23P55773 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCL23P55773 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCL23P55773 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCL23P55773 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCL23P55773 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCL23P55773 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCL23P55773 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCL23P55773 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCL23P55773 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCL23P55773 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCL23P55773 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCL23P55773 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCL23P55773 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCL23P55773 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCL23P55773 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCL23P55773 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCL23P55773 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCL23P55773 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCL23P55773 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCL23P55773 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCL23P55773 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCL23P55773 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCL23P55773 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCL23P55773 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCL23P55773 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCL23P55773 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCL23P55773 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCL23P55773 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCL23P55773 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCL23P55773 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCL23P55773 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCL23P55773 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCL23P55773 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCL23P55773 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCL23P55773 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCL23P55773 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCL23P55773 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCL23P55773 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCL23P55773 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCL23P55773 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCL23P55773 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 236.5 ms