Protein–RNA interactions for Protein: P54849

EMP1, Epithelial membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP1P54849 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMP1P54849 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMP1P54849 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMP1P54849 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMP1P54849 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMP1P54849 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMP1P54849 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMP1P54849 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMP1P54849 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMP1P54849 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMP1P54849 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMP1P54849 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMP1P54849 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMP1P54849 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMP1P54849 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EMP1P54849 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMP1P54849 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMP1P54849 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMP1P54849 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMP1P54849 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMP1P54849 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMP1P54849 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMP1P54849 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMP1P54849 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMP1P54849 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMP1P54849 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMP1P54849 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMP1P54849 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMP1P54849 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMP1P54849 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMP1P54849 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EMP1P54849 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMP1P54849 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMP1P54849 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMP1P54849 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMP1P54849 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMP1P54849 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMP1P54849 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMP1P54849 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMP1P54849 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMP1P54849 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMP1P54849 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EMP1P54849 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP1P54849 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP1P54849 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP1P54849 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP1P54849 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP1P54849 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP1P54849 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP1P54849 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP1P54849 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP1P54849 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP1P54849 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP1P54849 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP1P54849 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP1P54849 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP1P54849 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP1P54849 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMP1P54849 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMP1P54849 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMP1P54849 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMP1P54849 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMP1P54849 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMP1P54849 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EMP1P54849 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EMP1P54849 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMP1P54849 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMP1P54849 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMP1P54849 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMP1P54849 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMP1P54849 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMP1P54849 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMP1P54849 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMP1P54849 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMP1P54849 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMP1P54849 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMP1P54849 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMP1P54849 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMP1P54849 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMP1P54849 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMP1P54849 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMP1P54849 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMP1P54849 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
EMP1P54849 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMP1P54849 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMP1P54849 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMP1P54849 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMP1P54849 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMP1P54849 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMP1P54849 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMP1P54849 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMP1P54849 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMP1P54849 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMP1P54849 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMP1P54849 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMP1P54849 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMP1P54849 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMP1P54849 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMP1P54849 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMP1P54849 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms