Protein–RNA interactions for Protein: P52954

LBX1, Transcription factor LBX1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX1P52954 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LBX1P52954 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LBX1P52954 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LBX1P52954 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LBX1P52954 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LBX1P52954 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LBX1P52954 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LBX1P52954 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LBX1P52954 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LBX1P52954 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LBX1P52954 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LBX1P52954 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LBX1P52954 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LBX1P52954 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LBX1P52954 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LBX1P52954 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LBX1P52954 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LBX1P52954 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LBX1P52954 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LBX1P52954 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LBX1P52954 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LBX1P52954 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LBX1P52954 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LBX1P52954 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LBX1P52954 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LBX1P52954 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LBX1P52954 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LBX1P52954 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LBX1P52954 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LBX1P52954 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LBX1P52954 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LBX1P52954 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LBX1P52954 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LBX1P52954 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LBX1P52954 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LBX1P52954 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LBX1P52954 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LBX1P52954 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LBX1P52954 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LBX1P52954 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LBX1P52954 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LBX1P52954 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LBX1P52954 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LBX1P52954 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LBX1P52954 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LBX1P52954 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LBX1P52954 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LBX1P52954 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LBX1P52954 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LBX1P52954 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LBX1P52954 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LBX1P52954 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LBX1P52954 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LBX1P52954 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LBX1P52954 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LBX1P52954 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LBX1P52954 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LBX1P52954 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LBX1P52954 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LBX1P52954 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LBX1P52954 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LBX1P52954 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LBX1P52954 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LBX1P52954 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LBX1P52954 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LBX1P52954 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LBX1P52954 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LBX1P52954 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LBX1P52954 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LBX1P52954 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LBX1P52954 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LBX1P52954 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LBX1P52954 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LBX1P52954 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LBX1P52954 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LBX1P52954 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LBX1P52954 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LBX1P52954 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LBX1P52954 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LBX1P52954 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LBX1P52954 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LBX1P52954 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LBX1P52954 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LBX1P52954 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LBX1P52954 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LBX1P52954 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LBX1P52954 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LBX1P52954 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LBX1P52954 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LBX1P52954 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LBX1P52954 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LBX1P52954 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LBX1P52954 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LBX1P52954 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LBX1P52954 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LBX1P52954 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LBX1P52954 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LBX1P52954 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LBX1P52954 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LBX1P52954 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms