Protein–RNA interactions for Protein: P52272

HNRNPM, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPMP52272 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 27
HNRNPMP52272 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.413e-6■■■■■ 27
HNRNPMP52272 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.173e-6■■■■■ 27
HNRNPMP52272 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.133e-6■■■■■ 27
HNRNPMP52272 GAB2-206ENST00000530915 567 ntTSL 434■■■■□ 3.033e-10■■■■■ 27
HNRNPMP52272 GAB2-207ENST00000534823 568 ntTSL 332.28■■■□□ 2.763e-10■■■■■ 27
HNRNPMP52272 GAB2-203ENST00000526030 650 ntTSL 331.86■■■□□ 2.693e-10■■■■■ 27
HNRNPMP52272 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.343e-10■■■■■ 27
HNRNPMP52272 GAB2-205ENST00000528886 543 ntTSL 415.23■□□□□ 0.033e-10■■■■■ 27
HNRNPMP52272 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.076e-10■■■■■ 27
HNRNPMP52272 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.826e-10■■■■■ 27
HNRNPMP52272 QKI-209ENST00000537124 551 ntTSL 515.14■□□□□ 0.013e-7■■■■■ 26.9
HNRNPMP52272 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.628e-7■■■■■ 26.9
HNRNPMP52272 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.968e-7■■■■■ 26.9
HNRNPMP52272 ANKRD11-209ENST00000564553 471 ntTSL 321.39■■□□□ 1.013e-7■■■■■ 26.9
HNRNPMP52272 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.925e-8■■■■■ 26.9
HNRNPMP52272 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.175e-8■■■■■ 26.9
HNRNPMP52272 NSUN2-203ENST00000504374 3217 ntTSL 222.33■■□□□ 1.175e-8■■■■■ 26.9
HNRNPMP52272 ROR2-208ENST00000550066 4360 ntTSL 213.45□□□□□ -0.261e-6■■■■■ 26.9
HNRNPMP52272 BLCAP-213ENST00000467603 439 ntTSL 325.2■■□□□ 1.626e-7■■■■■ 26.9
HNRNPMP52272 RFWD2-207ENST00000474194 975 ntTSL 339.16■■■■□ 3.869e-7■■■■■ 26.9
HNRNPMP52272 RFWD2-209ENST00000491600 773 ntTSL 57.66□□□□□ -1.189e-7■■■■■ 26.9
HNRNPMP52272 RFWD2-210ENST00000498306 617 ntTSL 55.49□□□□□ -1.539e-7■■■■■ 26.9
HNRNPMP52272 FANCA-202ENST00000389301 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.047e-8■■■■■ 26.9
HNRNPMP52272 FANCA-230ENST00000568369 4601 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.267e-8■■■■■ 26.9
HNRNPMP52272 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.351e-6■■■■■ 26.9
HNRNPMP52272 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.584e-18■■■■■ 26.9
HNRNPMP52272 RBM4-208ENST00000510173 782 ntTSL 322.86■■□□□ 1.254e-18■■■■■ 26.9
HNRNPMP52272 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.014e-18■■■■■ 26.9
HNRNPMP52272 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.014e-18■■■■■ 26.9
HNRNPMP52272 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.934e-18■■■■■ 26.9
HNRNPMP52272 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.74e-18■■■■■ 26.9
HNRNPMP52272 RBM4-202ENST00000396053 1337 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.694e-18■■■■■ 26.9
HNRNPMP52272 RBM4-205ENST00000409406 2321 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.574e-18■■■■■ 26.9
HNRNPMP52272 RBM4-210ENST00000528039 764 ntTSL 317.95■□□□□ 0.464e-18■■■■■ 26.9
HNRNPMP52272 RBM4-206ENST00000483858 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.334e-18■■■■■ 26.9
HNRNPMP52272 RBM4-213ENST00000578778 582 ntTSL 4 BASIC10.93□□□□□ -0.664e-18■■■■■ 26.9
HNRNPMP52272 ANKRD11-216ENST00000568924 587 ntTSL 421.3■■□□□ 11e-7■■■■■ 26.9
HNRNPMP52272 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.511e-6■■■■■ 26.9
HNRNPMP52272 WDR60-203ENST00000444851 2769 ntTSL 1 (best)18.36■□□□□ 0.539e-7■■■■■ 26.9
HNRNPMP52272 WDR60-205ENST00000467220 5410 ntTSL 216.47■□□□□ 0.239e-7■■■■■ 26.9
HNRNPMP52272 RGS12-214ENST00000508158 2121 ntTSL 221.7■■□□□ 1.069e-8■■■■■ 26.9
HNRNPMP52272 RGS12-207ENST00000504194 3522 ntTSL 1 (best)16.56■□□□□ 0.249e-8■■■■■ 26.9
HNRNPMP52272 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.52e-10■■■■■ 26.8
HNRNPMP52272 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.022e-10■■■■■ 26.8
HNRNPMP52272 ESYT2-202ENST00000275418 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 527.88■■■□□ 2.053e-8■■■■■ 26.8
HNRNPMP52272 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.613e-8■■■■■ 26.8
HNRNPMP52272 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.313e-8■■■■■ 26.8
HNRNPMP52272 DNAH14-211ENST00000445597 10524 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.417e-7■■■■■ 26.8
HNRNPMP52272 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.327e-7■■■■■ 26.8
HNRNPMP52272 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.64e-7■■■■■ 26.8
HNRNPMP52272 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.614e-7■■■■■ 26.8
HNRNPMP52272 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.544e-7■■■■■ 26.8
HNRNPMP52272 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.44e-7■■■■■ 26.8
HNRNPMP52272 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.44e-7■■■■■ 26.8
HNRNPMP52272 AFDN-207ENST00000400822 7593 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.264e-7■■■■■ 26.8
HNRNPMP52272 U2AF2-205ENST00000588850 637 ntTSL 223.94■■□□□ 1.428e-7■■■■■ 26.8
HNRNPMP52272 U2AF2-203ENST00000587196 778 ntTSL 322.89■■□□□ 1.258e-7■■■■■ 26.8
HNRNPMP52272 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC46.5■■■■■ 5.036e-8■■■■■ 26.8
HNRNPMP52272 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC44.35■■■■■ 4.696e-8■■■■■ 26.8
HNRNPMP52272 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.636e-8■■■■■ 26.8
HNRNPMP52272 HAGHL-202ENST00000389701 1295 ntTSL 1 (best)37.62■■■■□ 3.616e-8■■■■■ 26.8
HNRNPMP52272 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.076e-8■■■■■ 26.8
HNRNPMP52272 HAGHL-217ENST00000569143 564 ntTSL 433.01■■■□□ 2.876e-8■■■■■ 26.8
HNRNPMP52272 VOPP1-210ENST00000453112 552 ntTSL 432.91■■■□□ 2.866e-8■■■■■ 26.8
HNRNPMP52272 HAGHL-214ENST00000567414 735 ntTSL 232.33■■■□□ 2.776e-8■■■■■ 26.8
HNRNPMP52272 VOPP1-209ENST00000452832 485 ntTSL 231.69■■■□□ 2.666e-8■■■■■ 26.8
HNRNPMP52272 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.66e-8■■■■■ 26.8
HNRNPMP52272 HAGHL-207ENST00000561750 675 ntTSL 231.28■■■□□ 2.66e-8■■■■■ 26.8
HNRNPMP52272 HAGHL-215ENST00000567696 2199 ntTSL 231.03■■■□□ 2.566e-8■■■■■ 26.8
HNRNPMP52272 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.56e-8■■■■■ 26.8
HNRNPMP52272 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.36e-8■■■■■ 26.8
HNRNPMP52272 VOPP1-214ENST00000462326 536 ntTSL 429.4■■■□□ 2.36e-8■■■■■ 26.8
HNRNPMP52272 HAGHL-216ENST00000568141 740 ntTSL 227.92■■■□□ 2.066e-8■■■■■ 26.8
HNRNPMP52272 HAGHL-208ENST00000562141 650 ntTSL 527.56■■■□□ 26e-8■■■■■ 26.8
HNRNPMP52272 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.976e-8■■■■■ 26.8
HNRNPMP52272 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.816e-8■■■■■ 26.8
HNRNPMP52272 POLD2-217ENST00000496539 571 ntTSL 226.09■■□□□ 1.776e-8■■■■■ 26.8
HNRNPMP52272 ABCC5-207ENST00000437341 591 ntTSL 525.42■■□□□ 1.666e-8■■■■■ 26.8
HNRNPMP52272 VOPP1-215ENST00000471168 582 ntTSL 425.41■■□□□ 1.666e-8■■■■■ 26.8
HNRNPMP52272 POLD2-203ENST00000418438 556 ntTSL 424.56■■□□□ 1.526e-8■■■■■ 26.8
HNRNPMP52272 HELLS-207ENST00000419900 711 ntTSL 324.5■■□□□ 1.516e-8■■■■■ 26.8
HNRNPMP52272 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.466e-8■■■■■ 26.8
HNRNPMP52272 RMDN1-215ENST00000522804 968 ntTSL 324.12■■□□□ 1.456e-8■■■■■ 26.8
HNRNPMP52272 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.256e-8■■■■■ 26.8
HNRNPMP52272 POLD2-209ENST00000461116 420 ntTSL 222.19■■□□□ 1.146e-8■■■■■ 26.8
HNRNPMP52272 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.976e-8■■■■■ 26.8
HNRNPMP52272 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.966e-8■■■■■ 26.8
HNRNPMP52272 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.966e-8■■■■■ 26.8
HNRNPMP52272 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.946e-8■■■■■ 26.8
HNRNPMP52272 HAGHL-209ENST00000562187 100 ntTSL 320.15■□□□□ 0.826e-8■■■■■ 26.8
HNRNPMP52272 ABCC5-208ENST00000438979 821 ntTSL 520.11■□□□□ 0.816e-8■■■■■ 26.8
HNRNPMP52272 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.796e-8■■■■■ 26.8
HNRNPMP52272 VOPP1-204ENST00000418904 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.776e-8■■■■■ 26.8
HNRNPMP52272 FAM173B-202ENST00000504390 571 ntTSL 519.88■□□□□ 0.776e-8■■■■■ 26.8
HNRNPMP52272 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.776e-8■■■■■ 26.8
HNRNPMP52272 FAM173B-206ENST00000510052 534 ntTSL 518.11■□□□□ 0.496e-8■■■■■ 26.8
HNRNPMP52272 RPL37-202ENST00000504562 505 ntTSL 217.73■□□□□ 0.436e-8■■■■■ 26.8
HNRNPMP52272 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.396e-8■■■■■ 26.8
HNRNPMP52272 VOPP1-212ENST00000454227 610 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.366e-8■■■■■ 26.8
Retrieved 100 of 21,363 protein–RNA pairs in 341.2 ms