Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC37.72■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC37.7■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC37.7■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC37.65■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
SMARCA2P51531 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms