Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UTRNP46939 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UTRNP46939 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UTRNP46939 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UTRNP46939 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UTRNP46939 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UTRNP46939 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UTRNP46939 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UTRNP46939 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UTRNP46939 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UTRNP46939 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UTRNP46939 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UTRNP46939 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UTRNP46939 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UTRNP46939 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UTRNP46939 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UTRNP46939 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UTRNP46939 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UTRNP46939 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UTRNP46939 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
UTRNP46939 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UTRNP46939 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UTRNP46939 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UTRNP46939 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UTRNP46939 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UTRNP46939 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UTRNP46939 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
UTRNP46939 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UTRNP46939 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
UTRNP46939 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UTRNP46939 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UTRNP46939 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UTRNP46939 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UTRNP46939 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UTRNP46939 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UTRNP46939 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
UTRNP46939 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UTRNP46939 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UTRNP46939 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UTRNP46939 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UTRNP46939 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UTRNP46939 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UTRNP46939 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
UTRNP46939 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UTRNP46939 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UTRNP46939 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
UTRNP46939 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
UTRNP46939 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UTRNP46939 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UTRNP46939 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UTRNP46939 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UTRNP46939 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
UTRNP46939 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UTRNP46939 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UTRNP46939 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
UTRNP46939 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UTRNP46939 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UTRNP46939 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UTRNP46939 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UTRNP46939 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UTRNP46939 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UTRNP46939 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UTRNP46939 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UTRNP46939 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UTRNP46939 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
UTRNP46939 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
UTRNP46939 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UTRNP46939 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UTRNP46939 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UTRNP46939 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UTRNP46939 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UTRNP46939 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UTRNP46939 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UTRNP46939 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UTRNP46939 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UTRNP46939 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UTRNP46939 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UTRNP46939 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UTRNP46939 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UTRNP46939 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
UTRNP46939 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UTRNP46939 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UTRNP46939 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UTRNP46939 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UTRNP46939 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UTRNP46939 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UTRNP46939 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UTRNP46939 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UTRNP46939 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UTRNP46939 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UTRNP46939 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UTRNP46939 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UTRNP46939 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UTRNP46939 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UTRNP46939 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UTRNP46939 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UTRNP46939 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UTRNP46939 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UTRNP46939 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UTRNP46939 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms