Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP5P45974 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP5P45974 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP5P45974 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP5P45974 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP5P45974 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP5P45974 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP5P45974 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP5P45974 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP5P45974 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP5P45974 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP5P45974 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP5P45974 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP5P45974 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP5P45974 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP5P45974 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP5P45974 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP5P45974 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP5P45974 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP5P45974 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP5P45974 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP5P45974 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP5P45974 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP5P45974 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP5P45974 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP5P45974 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP5P45974 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP5P45974 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP5P45974 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP5P45974 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP5P45974 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP5P45974 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP5P45974 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
USP5P45974 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP5P45974 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
USP5P45974 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP5P45974 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP5P45974 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP5P45974 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP5P45974 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP5P45974 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP5P45974 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP5P45974 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP5P45974 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP5P45974 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP5P45974 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP5P45974 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP5P45974 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP5P45974 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
USP5P45974 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
USP5P45974 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
USP5P45974 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP5P45974 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP5P45974 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP5P45974 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP5P45974 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP5P45974 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP5P45974 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP5P45974 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP5P45974 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP5P45974 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP5P45974 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP5P45974 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP5P45974 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP5P45974 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP5P45974 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP5P45974 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP5P45974 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP5P45974 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP5P45974 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP5P45974 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP5P45974 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP5P45974 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP5P45974 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25■■□□□ 1.59
USP5P45974 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP5P45974 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP5P45974 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP5P45974 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP5P45974 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP5P45974 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25■■□□□ 1.59
USP5P45974 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25■■□□□ 1.59
USP5P45974 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP5P45974 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP5P45974 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP5P45974 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP5P45974 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP5P45974 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP5P45974 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP5P45974 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP5P45974 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP5P45974 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP5P45974 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP5P45974 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP5P45974 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP5P45974 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP5P45974 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP5P45974 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP5P45974 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP5P45974 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
USP5P45974 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms