Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSR1P43307 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSR1P43307 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSR1P43307 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSR1P43307 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSR1P43307 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SSR1P43307 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SSR1P43307 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSR1P43307 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSR1P43307 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSR1P43307 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SSR1P43307 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSR1P43307 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSR1P43307 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSR1P43307 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSR1P43307 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSR1P43307 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSR1P43307 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SSR1P43307 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSR1P43307 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSR1P43307 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSR1P43307 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSR1P43307 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSR1P43307 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSR1P43307 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSR1P43307 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSR1P43307 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSR1P43307 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSR1P43307 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSR1P43307 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSR1P43307 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSR1P43307 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSR1P43307 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSR1P43307 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSR1P43307 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSR1P43307 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSR1P43307 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSR1P43307 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SSR1P43307 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSR1P43307 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSR1P43307 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSR1P43307 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSR1P43307 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSR1P43307 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSR1P43307 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SSR1P43307 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSR1P43307 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSR1P43307 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSR1P43307 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSR1P43307 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSR1P43307 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSR1P43307 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SSR1P43307 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSR1P43307 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSR1P43307 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSR1P43307 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SSR1P43307 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SSR1P43307 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSR1P43307 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSR1P43307 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSR1P43307 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSR1P43307 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSR1P43307 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSR1P43307 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSR1P43307 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSR1P43307 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSR1P43307 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SSR1P43307 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SSR1P43307 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SSR1P43307 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SSR1P43307 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SSR1P43307 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSR1P43307 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSR1P43307 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSR1P43307 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSR1P43307 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SSR1P43307 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSR1P43307 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSR1P43307 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSR1P43307 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSR1P43307 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SSR1P43307 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSR1P43307 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSR1P43307 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSR1P43307 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSR1P43307 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSR1P43307 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSR1P43307 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSR1P43307 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSR1P43307 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSR1P43307 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSR1P43307 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSR1P43307 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSR1P43307 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSR1P43307 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSR1P43307 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSR1P43307 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSR1P43307 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSR1P43307 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SSR1P43307 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms