Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIK3CBP42338 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PIK3CBP42338 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PIK3CBP42338 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PIK3CBP42338 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PIK3CBP42338 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PIK3CBP42338 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3CBP42338 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3CBP42338 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3CBP42338 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3CBP42338 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3CBP42338 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3CBP42338 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3CBP42338 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3CBP42338 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3CBP42338 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3CBP42338 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3CBP42338 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3CBP42338 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3CBP42338 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIK3CBP42338 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3CBP42338 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3CBP42338 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3CBP42338 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3CBP42338 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3CBP42338 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3CBP42338 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3CBP42338 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3CBP42338 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3CBP42338 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3CBP42338 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3CBP42338 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3CBP42338 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3CBP42338 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3CBP42338 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3CBP42338 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIK3CBP42338 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PIK3CBP42338 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PIK3CBP42338 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PIK3CBP42338 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PIK3CBP42338 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms