Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIA2P42262 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GRIA2P42262 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms