Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TMPOP42166 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMPOP42166 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
TMPOP42166 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TMPOP42166 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TMPOP42166 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TMPOP42166 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMPOP42166 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMPOP42166 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMPOP42166 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TMPOP42166 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMPOP42166 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMPOP42166 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
TMPOP42166 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMPOP42166 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TMPOP42166 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TMPOP42166 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TMPOP42166 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
TMPOP42166 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TMPOP42166 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TMPOP42166 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMPOP42166 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMPOP42166 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMPOP42166 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TMPOP42166 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMPOP42166 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMPOP42166 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TMPOP42166 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMPOP42166 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TMPOP42166 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMPOP42166 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMPOP42166 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TMPOP42166 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMPOP42166 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TMPOP42166 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMPOP42166 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TMPOP42166 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMPOP42166 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMPOP42166 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TMPOP42166 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TMPOP42166 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TMPOP42166 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TMPOP42166 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TMPOP42166 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TMPOP42166 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
TMPOP42166 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMPOP42166 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMPOP42166 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
TMPOP42166 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMPOP42166 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMPOP42166 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMPOP42166 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMPOP42166 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMPOP42166 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMPOP42166 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMPOP42166 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMPOP42166 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMPOP42166 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMPOP42166 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMPOP42166 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMPOP42166 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TMPOP42166 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMPOP42166 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMPOP42166 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMPOP42166 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMPOP42166 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMPOP42166 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMPOP42166 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TMPOP42166 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMPOP42166 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMPOP42166 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMPOP42166 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMPOP42166 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMPOP42166 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMPOP42166 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMPOP42166 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMPOP42166 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMPOP42166 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMPOP42166 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMPOP42166 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMPOP42166 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMPOP42166 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMPOP42166 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMPOP42166 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMPOP42166 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMPOP42166 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMPOP42166 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMPOP42166 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMPOP42166 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMPOP42166 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMPOP42166 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMPOP42166 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMPOP42166 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMPOP42166 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMPOP42166 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMPOP42166 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMPOP42166 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMPOP42166 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TMPOP42166 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMPOP42166 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms