Protein–RNA interactions for Protein: P42127

ASIP, Agouti-signaling protein, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIPP42127 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIPP42127 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIPP42127 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIPP42127 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIPP42127 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIPP42127 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIPP42127 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIPP42127 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIPP42127 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIPP42127 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ASIPP42127 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASIPP42127 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASIPP42127 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASIPP42127 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASIPP42127 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASIPP42127 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASIPP42127 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASIPP42127 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASIPP42127 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASIPP42127 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASIPP42127 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASIPP42127 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ASIPP42127 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASIPP42127 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASIPP42127 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASIPP42127 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASIPP42127 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASIPP42127 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASIPP42127 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASIPP42127 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASIPP42127 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASIPP42127 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASIPP42127 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASIPP42127 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ASIPP42127 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASIPP42127 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASIPP42127 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASIPP42127 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASIPP42127 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASIPP42127 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASIPP42127 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASIPP42127 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASIPP42127 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ASIPP42127 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ASIPP42127 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASIPP42127 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASIPP42127 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASIPP42127 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASIPP42127 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ASIPP42127 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ASIPP42127 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ASIPP42127 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ASIPP42127 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ASIPP42127 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ASIPP42127 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ASIPP42127 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIPP42127 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIPP42127 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIPP42127 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIPP42127 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIPP42127 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIPP42127 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIPP42127 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIPP42127 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIPP42127 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIPP42127 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIPP42127 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIPP42127 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIPP42127 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIPP42127 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIPP42127 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIPP42127 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIPP42127 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIPP42127 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIPP42127 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ASIPP42127 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIPP42127 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIPP42127 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIPP42127 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIPP42127 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIPP42127 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIPP42127 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIPP42127 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIPP42127 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIPP42127 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIPP42127 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIPP42127 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIPP42127 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIPP42127 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIPP42127 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIPP42127 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIPP42127 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIPP42127 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIPP42127 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIPP42127 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ASIPP42127 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIPP42127 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIPP42127 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIPP42127 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ASIPP42127 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms