Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP8P40818 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP8P40818 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP8P40818 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP8P40818 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP8P40818 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP8P40818 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP8P40818 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP8P40818 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP8P40818 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP8P40818 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP8P40818 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP8P40818 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP8P40818 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP8P40818 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP8P40818 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP8P40818 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP8P40818 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
USP8P40818 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP8P40818 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP8P40818 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP8P40818 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP8P40818 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP8P40818 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP8P40818 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP8P40818 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP8P40818 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP8P40818 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP8P40818 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP8P40818 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP8P40818 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP8P40818 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USP8P40818 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP8P40818 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP8P40818 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP8P40818 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP8P40818 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP8P40818 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP8P40818 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP8P40818 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP8P40818 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP8P40818 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP8P40818 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP8P40818 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP8P40818 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
USP8P40818 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP8P40818 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
USP8P40818 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP8P40818 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP8P40818 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP8P40818 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP8P40818 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP8P40818 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP8P40818 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP8P40818 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP8P40818 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP8P40818 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP8P40818 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP8P40818 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP8P40818 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP8P40818 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP8P40818 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP8P40818 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP8P40818 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP8P40818 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP8P40818 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP8P40818 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP8P40818 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP8P40818 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP8P40818 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP8P40818 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP8P40818 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP8P40818 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP8P40818 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP8P40818 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP8P40818 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP8P40818 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP8P40818 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP8P40818 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP8P40818 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP8P40818 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP8P40818 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP8P40818 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP8P40818 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP8P40818 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP8P40818 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP8P40818 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP8P40818 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP8P40818 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP8P40818 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP8P40818 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP8P40818 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP8P40818 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP8P40818 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP8P40818 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP8P40818 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP8P40818 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP8P40818 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP8P40818 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP8P40818 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms