Protein–RNA interactions for Protein: P40080

VFA1, VPS4-associated protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1P40080 SPT2YER161C 1002 nt3.6□□□□□ -1.83
VFA1P40080 LRP1YHR081W 555 nt3.6□□□□□ -1.83
VFA1P40080 YAP5YIR018W 738 nt3.6□□□□□ -1.83
VFA1P40080 RPL17BYJL177W 555 nt3.6□□□□□ -1.83
VFA1P40080 YJR037WYJR037W 384 nt3.6□□□□□ -1.83
VFA1P40080 AIM25YJR100C 984 nt3.6□□□□□ -1.83
VFA1P40080 SOD1YJR104C 465 nt3.6□□□□□ -1.83
VFA1P40080 YKE2YLR200W 345 nt3.6□□□□□ -1.83
VFA1P40080 GOT1YMR292W 417 nt3.6□□□□□ -1.83
VFA1P40080 VAM10YOR068C 345 nt3.6□□□□□ -1.83
VFA1P40080 VHR1YIL056W 1923 nt3.6□□□□□ -1.83
VFA1P40080 AUS1YOR011W 4185 nt3.59□□□□□ -1.83
VFA1P40080 TCO89YPL180W 2400 nt3.59□□□□□ -1.83
VFA1P40080 SAE2YGL175C 1038 nt3.59□□□□□ -1.83
VFA1P40080 YGR290WYGR290W 444 nt3.59□□□□□ -1.83
VFA1P40080 RUF22RUF22 515 nt3.59□□□□□ -1.83
VFA1P40080 MSN1YOL116W 1149 nt3.59□□□□□ -1.83
VFA1P40080 MSR1YHR091C 1932 nt3.59□□□□□ -1.83
VFA1P40080 SLM2YNL047C 1971 nt3.59□□□□□ -1.83
VFA1P40080 YDR089WYDR089W 2610 nt3.58□□□□□ -1.84
VFA1P40080 BEM4YPL161C 1902 nt3.58□□□□□ -1.84
VFA1P40080 VTC4YJL012C 2166 nt3.58□□□□□ -1.84
VFA1P40080 PSF1YDR013W 627 nt3.58□□□□□ -1.84
VFA1P40080 NTF2YER009W 378 nt3.58□□□□□ -1.84
VFA1P40080 PUG1YER185W 912 nt3.58□□□□□ -1.84
VFA1P40080 SLX9YGR081C 633 nt3.58□□□□□ -1.84
VFA1P40080 PAU13YHL046C 363 nt3.58□□□□□ -1.84
VFA1P40080 YIL014C-AYIL014C-A 315 nt3.58□□□□□ -1.84
VFA1P40080 RPC40YPR110C 1008 nt3.58□□□□□ -1.84
VFA1P40080 snR35snR35 204 nt3.58□□□□□ -1.84
VFA1P40080 ARF1YDL192W 546 nt3.57□□□□□ -1.84
VFA1P40080 GRX2YDR513W 432 nt3.57□□□□□ -1.84
VFA1P40080 FAR7YFR008W 666 nt3.57□□□□□ -1.84
VFA1P40080 YGL082WYGL082W 1146 nt3.57□□□□□ -1.84
VFA1P40080 KIP3YGL216W 2418 nt3.57□□□□□ -1.84
VFA1P40080 NEL1YHR035W 1893 nt3.57□□□□□ -1.84
VFA1P40080 VMA10YHR039C-A 345 nt3.57□□□□□ -1.84
VFA1P40080 SYS1YJL004C 612 nt3.57□□□□□ -1.84
VFA1P40080 ILM1YJR118C 612 nt3.57□□□□□ -1.84
VFA1P40080 PET123YOR158W 957 nt3.57□□□□□ -1.84
VFA1P40080 EXO5YBR163W 1758 nt3.57□□□□□ -1.84
VFA1P40080 SLK19YOR195W 2466 nt3.56□□□□□ -1.84
VFA1P40080 OSH2YDL019C 3852 nt3.56□□□□□ -1.84
VFA1P40080 GPI10YGL142C 1851 nt3.56□□□□□ -1.84
VFA1P40080 CAF130YGR134W 3369 nt3.56□□□□□ -1.84
VFA1P40080 YCR001WYCR001W 315 nt3.56□□□□□ -1.84
VFA1P40080 SRD1YCR018C 666 nt3.56□□□□□ -1.84
VFA1P40080 FMP10YER182W 735 nt3.56□□□□□ -1.84
VFA1P40080 SUP56tL(CAA)A 82 nt3.56□□□□□ -1.84
VFA1P40080 SUP53tL(CAA)C 82 nt3.56□□□□□ -1.84
VFA1P40080 YFL065CYFL065C 309 nt3.56□□□□□ -1.84
VFA1P40080 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt3.56□□□□□ -1.84
VFA1P40080 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt3.56□□□□□ -1.84
VFA1P40080 SUP54tL(CAA)G2 82 nt3.56□□□□□ -1.84
VFA1P40080 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt3.56□□□□□ -1.84
VFA1P40080 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt3.56□□□□□ -1.84
VFA1P40080 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt3.56□□□□□ -1.84
VFA1P40080 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt3.56□□□□□ -1.84
VFA1P40080 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt3.56□□□□□ -1.84
VFA1P40080 YGL039WYGL039W 1047 nt3.56□□□□□ -1.84
VFA1P40080 YHR212CYHR212C 336 nt3.56□□□□□ -1.84
VFA1P40080 YIL141WYIL141W 390 nt3.56□□□□□ -1.84
VFA1P40080 YJL119CYJL119C 324 nt3.56□□□□□ -1.84
VFA1P40080 YKL202WYKL202W 582 nt3.56□□□□□ -1.84
VFA1P40080 YAR060CYAR060C 336 nt3.56□□□□□ -1.84
VFA1P40080 ATP18YML081C-A 180 nt3.56□□□□□ -1.84
VFA1P40080 YNL184CYNL184C 327 nt3.56□□□□□ -1.84
VFA1P40080 YNL203CYNL203C 612 nt3.56□□□□□ -1.84
VFA1P40080 YOL114CYOL114C 609 nt3.56□□□□□ -1.84
VFA1P40080 GCY1YOR120W 939 nt3.56□□□□□ -1.84
VFA1P40080 MRPS9YBR146W 837 nt3.56□□□□□ -1.84
VFA1P40080 EMC1YCL045C 2283 nt3.56□□□□□ -1.84
VFA1P40080 YDL176WYDL176W 2127 nt3.55□□□□□ -1.84
VFA1P40080 REC8YPR007C 2043 nt3.55□□□□□ -1.84
VFA1P40080 RPO21YDL140C 5202 nt3.55□□□□□ -1.84
VFA1P40080 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt3.55□□□□□ -1.84
VFA1P40080 YDL187CYDL187C 330 nt3.55□□□□□ -1.84
VFA1P40080 YDR262WYDR262W 819 nt3.55□□□□□ -1.84
VFA1P40080 MTM1YGR257C 1101 nt3.55□□□□□ -1.84
VFA1P40080 AGE2YIL044C 897 nt3.55□□□□□ -1.84
VFA1P40080 ASG7YJL170C 630 nt3.55□□□□□ -1.84
VFA1P40080 AIM26YKL037W 357 nt3.55□□□□□ -1.84
VFA1P40080 VPS63YLR261C 327 nt3.55□□□□□ -1.84
VFA1P40080 RBL2YOR265W 321 nt3.55□□□□□ -1.84
VFA1P40080 MBA1YBR185C 837 nt3.55□□□□□ -1.84
VFA1P40080 TDA1YMR291W 1761 nt3.55□□□□□ -1.84
VFA1P40080 BRE5YNR051C 1548 nt3.54□□□□□ -1.84
VFA1P40080 ARP4YJL081C 1470 nt3.54□□□□□ -1.84
VFA1P40080 PRP22YER013W 3438 nt3.54□□□□□ -1.84
VFA1P40080 RVS161YCR009C 798 nt3.54□□□□□ -1.84
VFA1P40080 FIN1YDR130C 876 nt3.54□□□□□ -1.84
VFA1P40080 FRQ1YDR373W 573 nt3.54□□□□□ -1.84
VFA1P40080 YDR464C-AYDR464C-A 189 nt3.54□□□□□ -1.84
VFA1P40080 SDL1YIL167W 633 nt3.54□□□□□ -1.84
VFA1P40080 GTT2YLL060C 702 nt3.54□□□□□ -1.84
VFA1P40080 LTP1YPR073C 486 nt3.54□□□□□ -1.84
VFA1P40080 HFD1YMR110C 1599 nt3.54□□□□□ -1.84
VFA1P40080 SRP68YPL243W 1800 nt3.54□□□□□ -1.84
VFA1P40080 SEC6YIL068C 2418 nt3.53□□□□□ -1.84
VFA1P40080 CPR5YDR304C 678 nt3.53□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19 ms