Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FDFT1P37268 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
FDFT1P37268 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FDFT1P37268 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FDFT1P37268 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FDFT1P37268 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FDFT1P37268 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FDFT1P37268 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FDFT1P37268 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FDFT1P37268 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
FDFT1P37268 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FDFT1P37268 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FDFT1P37268 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FDFT1P37268 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FDFT1P37268 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FDFT1P37268 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FDFT1P37268 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FDFT1P37268 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FDFT1P37268 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FDFT1P37268 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FDFT1P37268 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FDFT1P37268 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FDFT1P37268 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FDFT1P37268 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FDFT1P37268 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FDFT1P37268 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FDFT1P37268 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FDFT1P37268 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FDFT1P37268 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FDFT1P37268 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FDFT1P37268 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FDFT1P37268 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FDFT1P37268 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FDFT1P37268 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FDFT1P37268 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FDFT1P37268 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FDFT1P37268 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FDFT1P37268 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FDFT1P37268 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FDFT1P37268 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
FDFT1P37268 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FDFT1P37268 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FDFT1P37268 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FDFT1P37268 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FDFT1P37268 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FDFT1P37268 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FDFT1P37268 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FDFT1P37268 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FDFT1P37268 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FDFT1P37268 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FDFT1P37268 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FDFT1P37268 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
FDFT1P37268 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
FDFT1P37268 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
FDFT1P37268 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FDFT1P37268 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FDFT1P37268 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FDFT1P37268 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FDFT1P37268 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms