Protein–RNA interactions for Protein: P35663

CYLC1, Cylicin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLC1P35663 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CYLC1P35663 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CYLC1P35663 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms