Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BMI1P35226 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BMI1P35226 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
BMI1P35226 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
BMI1P35226 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BMI1P35226 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BMI1P35226 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BMI1P35226 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BMI1P35226 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BMI1P35226 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BMI1P35226 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BMI1P35226 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BMI1P35226 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BMI1P35226 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BMI1P35226 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BMI1P35226 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BMI1P35226 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BMI1P35226 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BMI1P35226 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BMI1P35226 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BMI1P35226 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BMI1P35226 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BMI1P35226 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BMI1P35226 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BMI1P35226 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BMI1P35226 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BMI1P35226 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BMI1P35226 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BMI1P35226 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BMI1P35226 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BMI1P35226 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BMI1P35226 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BMI1P35226 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BMI1P35226 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BMI1P35226 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BMI1P35226 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BMI1P35226 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BMI1P35226 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BMI1P35226 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BMI1P35226 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BMI1P35226 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BMI1P35226 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BMI1P35226 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BMI1P35226 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BMI1P35226 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BMI1P35226 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
BMI1P35226 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BMI1P35226 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
BMI1P35226 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BMI1P35226 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BMI1P35226 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BMI1P35226 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BMI1P35226 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BMI1P35226 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BMI1P35226 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BMI1P35226 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BMI1P35226 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BMI1P35226 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BMI1P35226 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BMI1P35226 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BMI1P35226 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BMI1P35226 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BMI1P35226 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BMI1P35226 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
BMI1P35226 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BMI1P35226 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BMI1P35226 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BMI1P35226 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BMI1P35226 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BMI1P35226 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BMI1P35226 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BMI1P35226 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BMI1P35226 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BMI1P35226 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BMI1P35226 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BMI1P35226 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BMI1P35226 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BMI1P35226 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BMI1P35226 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BMI1P35226 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BMI1P35226 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BMI1P35226 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
BMI1P35226 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BMI1P35226 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BMI1P35226 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BMI1P35226 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BMI1P35226 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BMI1P35226 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BMI1P35226 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BMI1P35226 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BMI1P35226 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BMI1P35226 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BMI1P35226 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BMI1P35226 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BMI1P35226 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BMI1P35226 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BMI1P35226 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BMI1P35226 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BMI1P35226 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BMI1P35226 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms