Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA9P31269 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXA9P31269 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXA9P31269 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms