Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNGA1P29973 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CNGA1P29973 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms