Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ARID4AP29374 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ARID4AP29374 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARID4AP29374 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARID4AP29374 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms