Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTGFP29279 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTGFP29279 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTGFP29279 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CTGFP29279 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTGFP29279 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTGFP29279 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTGFP29279 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTGFP29279 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTGFP29279 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTGFP29279 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CTGFP29279 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTGFP29279 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTGFP29279 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTGFP29279 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTGFP29279 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTGFP29279 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTGFP29279 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTGFP29279 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTGFP29279 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CTGFP29279 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTGFP29279 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTGFP29279 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTGFP29279 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTGFP29279 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTGFP29279 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTGFP29279 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTGFP29279 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTGFP29279 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CTGFP29279 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CTGFP29279 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTGFP29279 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTGFP29279 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTGFP29279 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTGFP29279 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTGFP29279 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTGFP29279 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTGFP29279 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTGFP29279 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTGFP29279 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTGFP29279 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTGFP29279 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTGFP29279 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CTGFP29279 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTGFP29279 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTGFP29279 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTGFP29279 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTGFP29279 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTGFP29279 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTGFP29279 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTGFP29279 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTGFP29279 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTGFP29279 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTGFP29279 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTGFP29279 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTGFP29279 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CTGFP29279 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTGFP29279 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTGFP29279 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTGFP29279 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTGFP29279 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTGFP29279 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTGFP29279 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CTGFP29279 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTGFP29279 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CTGFP29279 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTGFP29279 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTGFP29279 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTGFP29279 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTGFP29279 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTGFP29279 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTGFP29279 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTGFP29279 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTGFP29279 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTGFP29279 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTGFP29279 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTGFP29279 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTGFP29279 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTGFP29279 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTGFP29279 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTGFP29279 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CTGFP29279 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTGFP29279 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTGFP29279 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTGFP29279 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTGFP29279 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTGFP29279 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTGFP29279 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTGFP29279 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CTGFP29279 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTGFP29279 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTGFP29279 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CTGFP29279 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTGFP29279 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTGFP29279 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTGFP29279 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTGFP29279 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTGFP29279 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTGFP29279 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTGFP29279 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms