Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJB2P29033 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GJB2P29033 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB2P29033 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB2P29033 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB2P29033 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB2P29033 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB2P29033 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB2P29033 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB2P29033 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB2P29033 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB2P29033 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB2P29033 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB2P29033 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB2P29033 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB2P29033 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB2P29033 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB2P29033 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB2P29033 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB2P29033 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB2P29033 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GJB2P29033 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB2P29033 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB2P29033 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB2P29033 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB2P29033 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB2P29033 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB2P29033 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB2P29033 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB2P29033 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB2P29033 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB2P29033 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB2P29033 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB2P29033 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB2P29033 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB2P29033 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB2P29033 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB2P29033 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB2P29033 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB2P29033 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB2P29033 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB2P29033 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GJB2P29033 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GJB2P29033 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJB2P29033 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJB2P29033 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJB2P29033 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJB2P29033 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJB2P29033 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJB2P29033 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJB2P29033 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJB2P29033 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJB2P29033 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GJB2P29033 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB2P29033 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB2P29033 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB2P29033 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB2P29033 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB2P29033 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB2P29033 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB2P29033 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB2P29033 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GJB2P29033 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJB2P29033 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJB2P29033 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJB2P29033 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJB2P29033 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJB2P29033 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJB2P29033 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJB2P29033 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GJB2P29033 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJB2P29033 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GJB2P29033 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GJB2P29033 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB2P29033 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB2P29033 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB2P29033 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB2P29033 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB2P29033 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB2P29033 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB2P29033 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB2P29033 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB2P29033 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB2P29033 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB2P29033 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB2P29033 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB2P29033 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB2P29033 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB2P29033 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB2P29033 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB2P29033 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GJB2P29033 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJB2P29033 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJB2P29033 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJB2P29033 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJB2P29033 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJB2P29033 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GJB2P29033 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJB2P29033 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GJB2P29033 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms