Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRDP23468 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRDP23468 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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