Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTPRBP23467 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPRBP23467 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
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