Protein–RNA interactions for Protein: P22460

KCNA5, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA5P22460 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNA5P22460 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNA5P22460 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNA5P22460 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNA5P22460 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
KCNA5P22460 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNA5P22460 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNA5P22460 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms