Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FGFR4P22455 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGFR4P22455 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms